Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc8P09025 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms