Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb6P09023 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms