Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-T23P06339 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms