Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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