Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms