Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tk1P04184 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms