Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01823 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01823 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01823 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01823 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms