Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01673 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01673 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01673 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms