Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01653 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01653 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01653 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms