Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms