Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms