Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CopeO89079 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CopeO89079 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CopeO89079 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CopeO89079 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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