Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnkO88874 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CcnkO88874 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnkO88874 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnkO88874 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnkO88874 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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