Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ShdO88834 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ShdO88834 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ShdO88834 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ShdO88834 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms