Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms