Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BlmO88700 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BlmO88700 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BlmO88700 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BlmO88700 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BlmO88700 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BlmO88700 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms