Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp2O88623 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms