Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1O70583 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms