Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Stra6O70491 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stra6O70491 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stra6O70491 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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