Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itgb5O70309 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms