Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top3aO70157 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms