Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms