Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlx3O55144 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlx3O55144 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlx3O55144 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlx3O55144 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlx3O55144 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlx3O55144 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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