Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms