Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms