Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnk2O54967 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms