Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms