Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp10aO54827 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms