Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srpk2O54781 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srpk2O54781 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srpk2O54781 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms