Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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