Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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