Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a6O35544 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms