Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk4O35493 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clk4O35493 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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