Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clk3O35492 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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