Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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