Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TnxbO35452 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms