Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms