Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc18a3O35304 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms