Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms