Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms