Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms