Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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