Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgisO35074 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgisO35074 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgisO35074 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms