Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Q1O19441 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms