Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms