Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms