Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp955bL7N232 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zfp955bL7N232 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms