Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms