Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms