Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm8888J3QPX5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms